Средства планирует выделить правительство России. Финансирование будет в рамках федеральной целевой программы «Охрана озера Байкал и социально-экономическое развитие Байкальской природной территории на 2012—2020 годы».
В первую очередь средства направят на природоохранные мероприятия и решение ряда экологических проблем в Байкальской природной территории. Уже в 2011 году более 1 миллиарда рублей пойдет на развитие особо охраняемых территорий: Байкало-Ленский, Баргузинский, Байкальский заповедники, Забайкальский и Прибайкальский национальные парки.
Планируется сократить до 50 % к 2020 году относительно 2011 года сбросы загрязняющих веществ в водные объекты Байкальской территории. Программа также предусматривает утилизацию и переработку накопленных промышленных отходов, повышение эффективности использования рекреационного потенциала озера, сохранение находящихся под угрозой исчезновения объектов растительного и животного мира, развитие системы защиты береговых линий природной территории и системы государственного экологического мониторинга.
Впервые программу по охране Байкала представили в сентябре 2010 года. Презентация прошла на Байкальском экономическом форуме.
